为确定自来水厂净水工艺改造方案，水质采样的关键是如何合理组合单元净水工艺。结合的前提是根据当地原水水质条件和要求，落实水质目标。一般来说，如果原水水质好，水质指标高，常规水处理和强化常规处理仍是较佳方案。如果水源条件有限，原水水质受到轻微污染，较好的办法是对原水进行一次完整的水文年中试，可以进行多个不同工艺的平行比较，分析净化效果。每个处理单元，通过技术经济比较，选择更合适的工艺组合。
充分掌握原水水质数据，明确各种水处理技术的适用条件，是选择合理的净水工艺的基础。
首先，要根据原水的水质，分析污染物是生物污染还是化学污染，或两者兼而有之；哪些污染物超标。
我国城市供水水源普遍受到污染，绝大多数水样为有机污染物。有机污染物非常复杂。现有的水处理技术需要从水质数据中分析其特性。例如，要区分溶解有机碳（DOC）占总有机碳（TAO）的比例，然后确定可降解（BDOC）和不可降解（nbdoc）在doc中的比例。
为了确定有机化合物的特性和毒性，需要通过GC/MS对水中有机化合物的种类进行定性分析。然后分析有机化合物的分子量，以确定不同组分的分子大小和比例。常规水处理工艺、增强常规处理工艺和深度处理（臭氧活性炭）对不同分子量的有机物的去除率不同。
我国供水水源中存在很多高氨氮。水质自动采样器中的氨氮是可降解有机物的中间产物。生物预处理是去除氨氮较好的方法，但在冬季气温较低时效果会降低。
对于原水中鉴定出的有机物，可通过试验或查阅相关资料确定污染物或超标污染物是否可被氧化。通过氧化剂氧化去除有机物也是水净化工艺之一。
活性炭吸附可以去除低分子t的有机物，提高普通水的感官特性。
水力循环澄清池的常规处理方法是增加泵混，改进絮凝方式，在沉淀区增加斜管，在第二絮凝室锥底和池底设置排泥管。
为挖掘平流沉淀池的潜力，一般采用快速搅拌、强化混凝、改善沉淀池水力条件、安装斜管（板）、减轻出水堰负荷等。
对于虹吸过滤器，配水系统主要改造成短柄滤头，条件允许时采用气水反冲洗。
对于普通的快速过滤器，应改进过滤介质，增加助滤剂的用量，并进行气水反冲洗。
水质的好坏与盛装容器也有很大关系，不锈钢水箱是目前来说比较环保的盛水容器，大家都知道许多餐具和医疗器材都采用的是304不锈钢，这均是由于不锈钢本身具有环保性能不会让水质受到二次污染的缘故。